《孤芳不自赏》和原著的差别之处，电视剧将根据市场和观众需要，在保留原著角色设定和人物关系之外，为了更好展示人物性格，符合故事发展，剧中的人物性格和原著会有一些改变。剧组对剧版《孤芳不自赏》的剧情内容进行了说明，并简要说明《孤芳不自赏》和原著改变的之处。
对于男女主角，剧版编剧简述，原著楚北捷是个威猛战神型，而在剧版中，楚北捷的形象将会改变成深情的暖男，平衡角色的刚毅性。而原著女主是个智慧沉着型，剧版主角要天真柔美一些，这样的角色才讨喜。
原著《孤芳不自赏》男女主角相识是因为琴，楚北捷不见人但听琴声就爱上女主的剧情将被改掉，剧组觉得这样的剧情太戏剧化，剧版将添加男女主从小就认识的剧情。
而小说中四个国家东林、归乐、云常、北漠将被改成魏晋南北朝时期的晋燕秦梁四国。对于这样的更改，原著粉丝显然是不买账的，评价道：说好听的是为了观众和故事情节需要改变，说不好听的，怕是为了通过广*电的审核吧。而对于增加男女主小时候就认识的剧情，网友评价道：按照故事和情节发展，这难道不是另一部《云中歌》吗?
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